黑龙江中医药大学始建于1954年，经六十余年的建设与发展，学校已成为具有较高教学、科研、医疗水平，在国内外有一定影响的高等中医药院校。学校于2004年全国首批获得教育部本科教学工作水平评估优秀结论，2007年全国首家通过教育部本科中医学专业认证单位，2008年被确定为国家中医临床研究基地建设单位，2014年晋升为全国文明单位，2015年荣获全国50所毕业生就业典型经验高校称号，2016年获批成为全国中医药文化宣传教育基地，2018年获批成为黑龙江省“高水平大学和优势特色学科建设高校”。
学校下设11个学院、11个附属医院（2个直属）、1个中医药研究院、27个教学医院和70个实习基地。设有24个本科专业，涵盖医、理、文、工、管、法等6个学科门类。有博士学位授予权一级学科4个、二级学科30个；有硕士学位授予权一级学科5个、二级学科36个；有博士专业学位授权点1个，硕士专业学位授权点4个。现有全日制在校生15221人，其中博士研究生299人、硕士研究生1947人、本科生10891人、专科生1742人、留学生288人。
学校设有中医学、中药学、中西医结合、药学4个博士后科研流动站，是国家第一类特色专业（中药学、药物制剂和针灸推拿学）和首批第二类特色专业（中医学）建设点。中药类人才培养模式创新实验区为教育部首批人才培养模式创新实验区，中医临床人才培养模式创新实验区为黑龙江省人才培养模式创新实验区。在全国第四轮学科评估中，中药学学科排名并列第一、中医学学科排名并列第四，成为全国获评“A+”学科的三所中医药院校之一。学校有国家重点学科4个、国家中医药管理局重点学科21个、省级重点学科11个、省领军人才梯队17个；有国家级教学团队3个、省级教学团队5个；有国家精品课程8门、国家精品资源共享课程8门、省精品课程22门。学校两次获全国优秀高等教育研究机构称号，曾先后获国家教学成果一等奖1项、二等奖6项、省级教学成果奖55项。教学实验中心为全国中医药院校首批确定的“国家级实验教学示范中心”。中医药文献检索中心被确定为中国中医药文献检索中心黑龙江分中心，为国家中医药管理局首批科技项目查新定点单位。